外科創建于1995年，秉承現代微創技術與傳統中醫藥相結合的理念，學科規模逐漸擴展，技術力量雄厚，開設有泌尿外科、普通外科、肛腸外科。科室人員梯隊合理，核心技術人員由深圳市外科學會普外科分會-泌尿外科分會委員及常務委員組成，不僅西醫技術全面，中西醫結合診療技術也有豐富經驗。

目前，深圳博愛曙光醫院外科70%的外科手術采用微創治療，極大減輕了病人痛苦，且手術效果較好。科室在“壹切以患者爲中心”的思想指導下，定期邀請省專家出診及手術指導，實現優質醫療衛生資源下沈，多方互通學習，提升診療服務能力。